DNA (ekstraksiyon) izolasyonu

Çilek/Kivi meyvesinde DNA izolasyonu

Rationale: Gerekçe:

In this lab activity, students will investigate DNA and later in the unit see how the understanding of DNA has lead scientists to develop technologies that are having far-reaching effects on biological research, medicine, public policy, and judicial systems.Öğrenciler, insanların sadece çok küçük bir yüzdesinin yaşamış olduğu, hücrelerden DNA ekstraksiyon  prosedürüne katılarak genç bilim adamları rolünü alacaktır. Procedures like this are similar to procedures used to make DNA fingerprints which require purified DNA. Bu gibi prosedürler arındırılmış DNA gerektiren DNA parmak izi elde etmek için kullanılan prosedürler ile benzerdir. 

Bu dersin sonunda öğrenciler:

·         Çilek DNA’sının neye benzediğini gözlemler ve açıklar.
·         DNA’ nın neye benzediğini önceki izlenimlerini ve gözlemleriyle karşılaştırır.
·         DNA'nın bu laboratuarda görülebileceğini açıklar.
·         Çözünürlüğün DNA’nın görünür kılınması ile ilgisinin olduğunu belirtir.
·         Diğer organizmalardan da DNA  elde edilebilir.
·         DNA izolasyonu önemini açıklar.

Malzemeler:
 

·         Kalın KİLİTLİ buzdolabı torbası
·         Taze / dondurulmuş çilek
·         Sıvı sabun
·         Tuz
·         40 mL etanol
·         Test tüpü ve tüplük
·         Huni ve süzgeç kağıdı
·         Ahşap / cam karıştırma çubuğu
·         Pipet
·         100 mL, 50 mL beher
 

Çilek DNA'sı izolasyonu

Purpose : To extract DNA from a strawberry plant Amaç: çilek bitkisinden DNA izole etmek

Overview : In this investigation you will break open strawberry cells, prepare a filtered extract containing strawberry DNA, and separate out molecules of DNA in a test tube.Genel Bakış: Bu araştırmada size, çilek hücrelerini parçalayarak, çilek DNA’sı içeren süzülmüş bir özü hazırlanacak ve bir test tüpünde DNA molekülleri özütten ayıracaktır.

Background : Strawberries are octoploid, meaning that every cell in a strawberry contains eight copies of each of its chromosomes. Açıklama: Çilek, her çilek hücresinin kromozomlarının her biri sekiz kopya içerir, yani octoploid vardır. A strawberry has 7 chromosomes in each set for a grand total of 56 chromosomes. Bir çilek hücresinde 56 kromozom vardır ancak takım sayısında (n) 7 kromozom vardır. As a result, strawberries contain large amounts of DNA. Bunun sonucu olarak, çilekler büyük miktarda DNA içerirler. After this lab, you will never eat a strawberry again without thinking about how much DNA is in it!

 

Prosedürler:

1. Kilitlipoşet içine koyduğunuz çilekleri ezin. Çileklerin ezilmesi, kolay ve olgun çilek hücre duvarlarının parçalanmasına katkıda bulunan enzimleri üretir buda Çilek DNA’sını çıkarmasını kolaylaştırır. These enzymes are known as cellulase and pectinase. Bu enzimler selülaz ve pektinaz olarak bilinir. To extract the DNA, you will first break strawberry cells apart mechanically, by crushing them. DNA izolasyonu için, ezilmesi mekanik olarak çilek hücreleri parçalayacak. Next, you will add detergents to dissolve the cell's plasma membranes.

2. Ezme işleminden sonra içine deterjan ilave edip ezmeye devam edin. Deterjan, hücrenin plazma zarı eritmek için kullanılacak. A filtering step then removes the cell debris.

3.İçine bir miktar tuz ilave edip ezmeye devam edin.

4.Elde edilen özütü beherglasa alın

5.Bir huni içine filtre kağıdı yerleştirin. Oluşan özüt bir filtre kağıdından geçirilerek hücre artıklarından arındırılır ve deney tüpünde biriktirilir.

6.Deney tüpünde The result will be a red colored solution containing DNA and other small dissolved molecules such as sugars and proteins. DNA, şekerler ve proteinler gibi diğer küçük molekülleri çözünmüş olarak içeren kırmızı renkli bir solüsyon oluşur. When cold ethanol is layered on top of this solution, molecules of ethanol repel the DNA molecules, and the DNA clumps together.

7. Bu çözeltiye kendi miktarı kadar soğuk etanol yavaşça ilave edilir,

8.Etanol molekülleri  DNA molekülleri, ve DNA topaklarını çözeltiden alarak üste toplanır. A ropelike clump of many DNA molecules forms that is large enough to see with the unaided eye. Çıplak gözle görülebilecek kadar büyük birçok DNA molekülleri etanol içinde bir yığın oluşturur.

9.Bir bagetle deney tüpü yavaşça karıştırılarak DNA toplanır.

 

Pre-lab Activity : Answer the following pre-lab questions prior to beginning the lab. laboratuvar Aktivitesi:.

1. To isolate strawberry DNA, you must separate it from other cell materials.            Çilek DNA'sı izole etmek için, diğer hücre maddelerinden ayırmak gerekir. Some of the lab steps you will use are listed in the left column below. Kullanacağınız laboratuvar adımlarının bazıları aşağıdaki sol sütunda listelenmiştir. Match the letter of each lab step with its effects on strawberry cells and enter your answers in the spaces provided. Çilek hücreleri üzerindeki etkileri ile her laboratuvar adımını eşleştirerek boşluklara cevapları girin.                  

Lab Steps Laboratuvar evreleri

Effects on Strawberry Cells Çilek hücreleri üzerindeki etkileri

a.      Mash the fruitÇilek süzülür b.      Çilek ezilir c.       Filter the strawberry extract Add detergent solutiSüzülmüş özü üzerine soğuk etanol eklenir d.      Deterjan  ve tuz eklenir Layer cold ethanol over filtered extrac

_______ breaks open the cells _______ Hücreler parçalanır _______ dissolves plasma membrane _______ Plazma zarı erir _______clumps DNA _______ DNA içeren sıvı kısım ayrılır _______separates organelles and cell debris, such as fragements of cell walls and membranes, from DNA and small dissolved molecules such as proteins and sugars _______ DNA   proteinler ve şekerler gibi küçük çözünmüş moleküllerden, hücre duvarlarının, organeller ve hücre zarı artıklarından ayrılır.

 

 

 

 

Asit - Baz Belirteci Yapalım

Deney Konusu: Mor lahana ile asit – baz belirteci yapma

Kullanılan Araç, Gereç ve Materyaller: Mor lahana, su ısıtıcısı, su, süzgeç kâğıdı, beyaz mendil, kağıt havlu, limon ve karbonat.

Deneyin Yapılışı:

1.    Mor lahana parçalara ayrılıp su dolu bir beher içerisine konulur. Belli bir süre su kaynatıldıktan sonra mor lahana rengini suya verir.

2.    Lahanalı su süzgeç kâğıdı yardımıyla süzüldükten sonra beyaz mendil üzerine bir miktar dökülür. Kâğıt havlular kullanılarak mendilin ıslaklığı giderilir.

3.    Mendilin üzerine limon dökülerek renk değişimi gözlenir.

4.    Mendilin üzerine karbonat dökülerek renk değişimi gözlenir.

İndikatör Nedir?

Herhangi bir maddenin test edilen ortamda varlığını gösteren ayıraca indikatör denir Renksiz reaktiflerden renksiz ürünlerin meydana gelmesi söz konusu olduğunda; ortama ilave edilerek renk değişiminden istifade edilerek reaksiyonun tamamlanıp tamamlanmadığının tespit edilmesi amacıyla kullanılan organik renklendiriciler.

SONUÇ: Turnusol kağıdı, pH metre, pH kağıdının yanı sıra doğal indikatörler de kullanılarak asit ve baz ayracı yapılabilir.

HAZIRLAYANLAR: Mustafa EMRE, Baran GÜCÜM, Ali İsa ÇİFTLİKLİ   9-B

diseksiyon

İç organlar diseksiyonu
Nisa GÖKÇEL 

Böbrek

 Böbrek yapısı

Böbrek kısımları

Trake (Soluk borusu) yapısı

Safra kesesi ve karaciğer

Karaciğer

Akciğer ve bronşlar

Kalp ve damarlar

 Kalbin kısımları

Kuş evi yapımı

Kuş evi yapımı
Öğrencilerimizde, kuş gözlemi ve yaban hayvanların korunması, biyoçeşitlilik, hayvan davranışları vb. konularda farkındalık yaratmak ve meraklarını gidermek amacıyla okul bahçesinde kuş evleri yapımı ve yerleştirilmesi planlanmıştır.
Kuş evleri yapımına yardımcı olmak amacıyla, model ve ölçüler aşağıda verilmiştir.

Model 1

Yukarıdaki modelde verilen ölçüler cm cinsindendir. Sarı çizgiler kesim bölgelerini göstermektedir. Malzemeler:  16 uygun çivi, 3 adet ağaç vidası(Hareketli ön parça için), 80x15 ve 30x11 boyutlarında iki tahta (Genişlik 2 cm) gereklidir.

Ayrıca montaj için gerekli araçlar: matkap, çekiç ve testere.

Model 2

Yukarıdaki modelde ölçüler cm olarak verilmiştir. Tek parça tahta yeterlidir.

Model 3

Not: Montajda tutkal, koruyucu ve boya  gibi kimyasallar kullanmayınız. Farklı materyaller kullanarak kuş evi üretebilirsiniz. Farklı modeller için aşağıdaki bağlantıyı inceleyin.
http://yabantutkusu.com/tag/kus-evleri-birds-house/

Laboratuvar kuralları

Laboratuvar çalışmalarında kurallara uyunuz!..
Laboratuvara yiyecek içecek getirmeyiniz.
Çalışmaların bittikten sonra, ortamı temizle.

Yiyeceklerde nişasta arama

DENEY   KONUSU :  Yiyeceklerde nişasta arama

Kullanılan Araç Gereç ve Materyal: Tentürdiyot, damlalık, karıştırma çubuğu, kağıt bardaklar, mısır nişastası ve çiğ patates, ekmek, vb. besin parçaları

Deneyin Yapılışı: Bir bardağın yarısına kadar su konulur. Üzerine biraz mısır nişastası ilave edilerek, bardağa 2 damla tentürdiyot eklenir ve karıştırılır. Bu uygulama diğer besinlerle de ayrı ayrı tekrarlanır

 NİŞASTA NEDİR ?
Bitkilerde depo maddesi olarak meydana getirilen polisakkarittir. Nişasta beyaz renkli, kokusuz, lezzetsiz bir tozdur. Soğuk suda çözünmez, sıcak suda kısmen çözünür ve bir pelte meydana getirir. İyot çözeltisi ile maviye boyanır. Mikroskop tetkiki ile hangi bitkiye ait olduğu saptanabilir. Çünkü nişasta tanelerinin şekli elde edildiği bitkiye göre özeldir.

Nişasta glikozdan yapılmış bir polisakkarittir. Asit veya fermentler ile hidroliz sonucu glikoz elde edilir. Nişasta bir gıda maddesidir. Eczacılık endüstrisinde komprimelerin yapımında dolgu maddesi olarak kullanılır. Dekstrin, glikoz ve amil alkol eldesinde bir ilkel maddedir.

Nişasta: Yalnızca bitkide depo besin maddesi olarak görülür. Çok sayıda glikoz molekülünün bir araya gelerek oluşturduğu bir yapıdır. Arpa, buğday, patates gibi besinlerde görülür. Suda erimezler. Hücre zarındaki porlardan geçemeyecek kadar büyük moleküllerdir. Hayvanlar nişastayı sindirim olayı ile glikoza dönüştürerek kullanırlar. Nişastanın ayıracı iyot çözeltisidir. Nişasta iyot çözeltisi ile mavi-mor renge dönüşür.

DENEYİN UYGULANIŞI

 

                                    Mısır nişastasının tentürdiyot damlatılmadan önceki ve sonraki halleri .

SONUÇ :  Tentürdiyot damlatılan yiyeceklerde renk değişimi gözleniyorsa o yiyeceğin yapısında nişasta var demektir. 

 Hazırlayan: Aynur ERDOĞDU 9-A 1930

 

İndikatör

GENEL RAPOR

 25 madde ile ölçüm yapıldı 16 fraklı madde tespit edildi.
Kara lahana suyu temiz bardaklara bir (az) miktar koyup üzerine pH sını merak ettiğiniz maddeleri ilave ediniz. Oluşan renk değişimini aşağıdaki tabloya yazınız.

KULLANILAN MADDE	İLK RENK	SON RENK	ASİT/BAZ
LİMON	SARI	MOR	ASİT
SİRKE	BEYAZ	KIRMIZI	ASİT
YOĞURT	BEYAZ	PEMBE	ASİT
MANDALİNA	TURUNCU	MOR	ASİT
ÜZÜM	SARI	PEMBE	ASİT
SABUN	BEYAZ	MAVİ	BAZ
EKŞİ AYRAN	BEYAZ	KIRMIZI	ASİT
ÇAMAŞIR SUYU	BEYAZ	YEŞİL	BAZ
EKŞİ ELMA	SARI	MOR	ASİT
DETERJAN	YEŞİL	MAVİMSİ	BAZ
HAVUÇ	TURUNCU	KIRMIZI (KOYU)	ASİT
KARBONAT	BEYAZ	MAVİ(AÇIK)	BAZ
GAZLI İÇECEK	SARI	PEMBE(AÇIK)	ASİT
DİŞ MACUNU	BEYAZ	MAVİ(KOYU)	BAZ
DOMATES	KIRMIZI	KIRMIZI	ASİT
KABARTMA TOZU	BEYAZ	MAVİ-YEŞİL	BAZ

PH	RENK
1	KIRMIZI
2	KIRMIZI
3	KIRMIZI
4	PEMBEMSİ
5	KIRMIZI
6	KIRMIZI
7	MAVİ
8	YEŞİL
9	YEŞİL
10	MAVİMSİ
11	MAVİMSİ
12	SARI
13	YEŞİL
14	YEŞİL

 

Benzer uygulama başka hangi madde ile yapılabilir

http://maycalistaylari.comu.edu.tr/sunumlar/projeraporlari/grup_antisionin_kimya.pdf    linkteki deneyde de görüldüğü gibi ahududu ve vişne indikatör olarak kullanılabilir.

İndikatör:

Çözeltinin pH’sına bağlı olarak renk değiştiren kompleks yapıdaki organik bileşiklere indikatör denir.

Tampon çözelti: Bir çözeltiye belli miktarlara kadar asit veya baz eklendiğinde, çözeltinin pH değerinin değişmesini engeller yönde tepkime verebilen özel çözeltilere “tampon çözelti” denir.

Sonuç Olarak:

Asit ve bazlar sadece yapay yollardan değil doğal indiktörler yardımı ile de ayrılabilir. Bunun bir örneği de mor lahanadır.Farklı maddelerin farklı pH ının bulunması ve bunun bilinmesi vücudumuza alacağımız asit ve bazların dengesinin sağlanması ve bu maddelerin dışarıdan dengeyele alınması açısından ayrı bir önem taşımaktadır.

                                                                                                                      

                                                                       Düzenleyen

                                                                HİLMİ EMRE ÖZDEMİR